Konvansiyonel (CTOL / Conventional Take-Off and Landing / F-35A), STOVL (Short Take-Off and Vertical Landing / F-35B) ve CATOBAR (Catapult Assisted Take-Off but Arrested Landing / F-35C) yöntemleri ile kalkış ve iniş gerçekleştiren F-35 Lightning II'ler, bahse konu kabiliyetler için bazı yapısal değişikliklere sahip.

Kraliyet Hava Kuvvetleri (Royal Air Force / RAF)'nin F-35B Lightning II'leri topsuz uçacak. Birleşik Krallık Savunma Bakanlığı'ndan yapılan açıklamada, hâlihazırda top podu tedariki planının bulunmadığı belirtildi. 

STOVL kabiliyetinin sağlanması için F-35B Lightning II'ler, orta gövde kısmında açılır-kapanır kapağın altında bir fan sistemine sahip. Bahse konu donanım, B model uçakların gövde içi sistem yerleşim planını kısıtlamakta. Bu nedenle platformların dâhili yakıt kapasitesi A ve C modellerine göre düşmüş; CTOL varyantta gövdenin sol iç kısmında yer alan 25 mm top donanımından vazgeçilmişti. F-35A Lightning II'lerde standart olarak gelen 25 mm GAU-22 topunun, F-35B'lerde gövde altında yer alan merkez istasyona monte edilebilir yapıda bir pod ile opsiyonel olarak uçaklara yüklenebilmesi çözümüne gidilmişti. 

Kraliyet Donanması ve Kraliyet Hava Kuvvetleri envanterindeki Harrier GR.9 ve GR.9A'ların emekliye ayrılmasının ardından Birleşik Krallık, yalnızca F-35B Lightning II tedarikine karar vermişti.

104 kilogram ağırlığında olan GAU-22/A, yüksek infilaklı ve zırh delici mühimmatları ateşleyebiliyor. Mayonlu ya da mayonsuz besleme sistemi ile çalışabilen silah, 16,5 kN geri tepme kuvvetine sahip.